El mayor peligro del fenol radica en que es un químico liposoluble que el cuerpo absorbe a través de la piel y pasa directamente al torrente sanguíneo.

1. Cardiotoxicidad: riesgo para el corazón: El fenol absorbido por la sangre puede inducir arritmias cardíacas graves —alteraciones en el ritmo del corazón— durante la aplicación. Por esta razón, el procedimiento requiere monitoreo electrocardiográfico continuo y una aplicación dividida por zonas faciales en intervalos de tiempo estrictos.
2. Toxicidad renal y hepática: Tanto los riñones como el hígado son los encargados de metabolizar y excretar el fenol del cuerpo. Una dosis mal calculada o una aplicación demasiado rápida puede sobrecargar estos órganos y causar daño sistémico.
3. Cicatrices hipertróficas y queloides: Si la profundidad de la quemadura química no se controla con precisión, la curación puede resultar en cicatrices permanentes, cambios irreparables en la textura de la piel o retracción de los tejidos, como ocurre en los párpados.
4. Cambios permanentes en la pigmentación: El fenol destruye los melanocitos, las células que producen el color de la piel. Esto puede ocasionar hipopigmentación permanente —la piel tratada queda definitivamente más clara que el resto del cuerpo— o hiperpigmentación postinflamatoria en forma de manchas oscuras, especialmente en personas con fototipos de piel oscuros o mestizos.
5. Alto riesgo de infección: Durante la primera y segunda semana posteriores al tratamiento, la cara queda prácticamente en carne viva. La pérdida de la barrera cutánea deja al organismo expuesto a infecciones bacterianas, fúngicas o brotes severos del virus del herpes simple.